Equipements disponibles

Principaux équipements disponibles

Utilisation des robots pour la préparation des échantillons à haut débit


          






            


Nombre de robots dans l'infrastructure MTH: 10

- MTH-Toulouse : 4

2 robots TECAN Evo 200 pour la culture et la préparation d'échantillons
2 robots TECAN Fluent pour l'analyse biochimique

- MTH-Bordeaux : 3

2 Robot de pipetage HAMILTON Microlab Starlet System pour le phénotypage à haut débit
1 Robot Bruker pour la titration du pH dans de très petits volumes

- MTH-Clermont-Ferrand : 2

1 robot Tecan Freedom EVO-2 200     
1 robot Bruker Sample Pro Tube à aiguilles  

- MTH-Paris : 16

Un Robot :
Plateforme robotisée HAMILTON Automate Microlab M / Bras HMotion / centrifugeuse Hettich Rotina. Multicanaux / 96w / cônes


15 équipements de spectrométrie de masse :
3 UHPLC-Q-Exactive (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Q-Exactive+ (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Orbitrap Fusion Tribrid (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Q-TOF Impact HD (Bruker), 1 UHPLC-Tims-TOF (Bruker), 1 UPLC-Xevo TQS (Waters), 1 UPLC-Xevo TQMS (Waters), 1 UPLC-Xevo TQXS (Waters), 1 MALDI-TOF/TOF (Bruker), 1 Exploris 120 (Thermo Fisher Scientific), 2 Exploris 240 (Thermo Fisher Scientific), 1 Xeno TOF (Sciex)



                     

Laboratoire de RMN, service et solutions RMN faisant appel à des couplages analytiques multi-techniques

L’expertise de MetaboHUB concerne la RMN liquide à haute et basse résolution, la RMN HR-MAS, le couplage de techniques analytiques associant la MS et la chromatographie et la polarisation nucléaire dynamique par dissolution (d-DNP).

L’infrastructure MetaboHUB dispose de quatorze aimants RMN, allant de 43 à 800 MHz, certains utilisant une cryosonde pour améliorer la sensibilité.
La technique de polarisation nucléaire dynamique par dissolution (d-DNP) qui permet d’amplifier de facteurs de plusieurs milliers leur polarisation est développée au sein de l'infrastructure.

Le personnel technique et scientifique réalisera des expérimentations de RMN pour vos projets (dans le cadre de prestations ou de collaborations) ou vous aidera à développer des méthodes spécifiques à vos besoins. Plusieurs spectromètres et leurs laboratoires attenants sont accessibles pour une utilisation directe par des scientifiques expérimentés en RMN.

Il est possible de réaliser des acquisitions RMN 1D et 2D sur des échantillons liquides et des expériences HR-MAS à partir de tissus ou d’autres échantillons biologiques solides. Pour des mélanges complexes particuliers / objectifs singuliers, il est possible de réaliser à façon des expérimentations de LC-RMN.
L’automatisation de la préparation des échantillons jusqu’aux analyses permet de proposer des analyses de RMN à haut-débit. Reliée à notre laboratoire de bioinformatique, une analyse in-silico assurera un traitement robuste des données.

Nombre de spectromètres de RMN dans l'infrastructure MTH: 15


MTH-Bordeaux: 2 équipements de RMN
- 500 MHz Avance III Bruker with its environment and cryoprobe
- 600 MHz Avance III Bruker with its environment (Including LC-SPE_NMR)

MTH-Toulouse: 3 équipements de RMN
- 500 MHz Ultrashiel Avance II (Bruker)
- 600 MHz Bruker Avance IIIHD (Bruker)
- 800 MHz Ascend Avance III avec une console Avance Neo et une cryoplateforme, sonde 5mm CQCI ,  sonde CTXI 1.7mm, sonde BBI 3mm, sonde CQCI 5mm (Bruker)

MTH-Clermont-Ferrand: 1 équipement de RMN
- 500 MHz AVANCE III Ultrashield NMR spectrometer equipped with a cryoprobe (Bruker)

MTH-Grand-Ouest: 10 équipements de RMN)
- 700 MHz AVANCE III HD Bruker equipped with a 1H/13C/15N/2H cryoprobe
- 500 MHz AVANCE III Bruker equipped with an inverse 1H/13C/BB grad-Z 5mm probe ; a micro-imaging X,Y,Z-grad probe ; and a flow equipment for real time monitoring
- 400 MHz AVANCE NEO Bruker equipped with a BBFO Prodigy grad-z cryoprobe
- Bruker d-DNP polariser prototype 7,05 T Solid-state low temperature probe for DNP with cross-polarization 1H/13C; Magnetic tunnel
- 400 MHz Pulse RS²D console - Bruker magnet 7,05 T DUAL+ 1H/13C ATMA grad-Z 5mm probe
- 400 MHz Avance III Bruker BBFO ATMA grad 5mm probe
- 300 MHz Avance I Bruker BBFO ATMA grad-Z 5mm probe
- 2 benchtop spectrometers de 43 MHz: Magritek Spinsolve 1H/19F 43 MHz gradient ; Magritek Spinsolve 1H/13C 43 MHz gradient ; equipped with flow systems


 

Nombre de spectromètres de masse au sein l'infrastructure : 67

- MTH-Paris: 13 équipements de masse
3 UHPLC-Q-Exactive (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Q-Exactive+ (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Orbitrap Fusion Tribrid (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Q-TOF Impact HD (Bruker), 1 UHPLC-Tims-TOF (Bruker), 1 UPLC-Xevo TQS (Waters), 1 UPLC-Xevo TQMS (Waters), 1 UPLC-QuattroTQMS (Waters), 1 LC-Exactive (Thermo Fisher Scientific) , 1 LC-QqQ Quatro Premier XE (Waters), 1 MALDI-TOF/TOF (Bruker)

- MTH-Bordeaux: 9 équipements de masse
1 UHPLC-QTRAP 5500 (ABSciex), 1 UHPLC-QTRAP 6500 (ABSciex), 1 UHPLC-Orbitap Elite (Thermo Fisher Scientific); 2 GC-MS Agilent 6850 (Agilent), 1 UHPLC-Quantum Max (Thermo Fisher Scientific), 1 UHPLC-Orbitrap Qexactive Plus (Thermo Fisher Scientific), 1 LC-MS Triple Quad 6430 (Agilent), 1 Esquire IT (Agilent)

- MTH-Toulouse: 18 équipements de masse
1 UPLC-LTQ Orbitrap XL (Thermo Fisher Scientific), 1 UPLC-QQQ Vantage (TermoFisher Scientific), 1 UPLC-MS QTOF SynaptG2Si (Waters), 1 LC-MS QQQ Altis (Termo Fisher Scientific), 1 LC-MS XevoG2-XS (Waters), 1 LC-MS-LTQ Orbitrap Velos (Thermo Fisher Scientific), 3 LC-MS-QExative PLus (Thermo Fisher Scientific), LC-MS QqQ 6460 (Agilent), 1 LC/UPC2-MS QTOF Xevo G2 XS (Waters), 1 MicroLC-MS QqQ 8060 (Shimadzu), 1 GC-MS TSQ Quantum (Thermo Fisher Scientific), 1 GC-MS TSQ  Quantum (Thermo Fisher Scientific), 1 GC-MS QqQ (Thermo Fisher Scientific), 1 LC/MALDI-QToF-IMMS (Bruker), 1 LC-QTrap 5500 (AB Sciex), 1 LC Exploris 240 (Thermo Fisher Scientific), 1  LC-MS QqQ  (Agilent)

- MTH-Clermont Ferrand: 12 équipements de masse
2 GC-MS 5975 (Agilent), 1 GC-MS/MS Quattro Micro (Waters), 1  GC-c-IRMS Isoprime (GV Instruments), 1 GC-QToF 7200B (Agilent), 1 LC-MS Quattro Micro (Waters), 1 LC-MS 5500 QTRAP (ABSciex), 1 LC-QToF Impact HD2, 1 TimsToF (Bruker), 1 LTQ Orbitrap Velos (Thermo Fisher Scientific), 1 Vision (IRMS 15N, elementar), 1 UPLC/SFC (Agilent)

- MTH-Grand-Ouest: 15 équipements de masse
1 LC-LTQ Orbitrap XL (Thermo Fisher Scientific), 1 LC-Xevo TQS (Waters), 1 LC-Synapt-G2 HDMS (Waters), 2 LC-Exactive (Thermo Fisher Scientific), 1 GC-Scion (Bruker) , 1 GC-Xevo TQS (Waters), 1 GCxGC-ToF (Markes), 1 GC-Qexactive (Thermo Fisher Scientific), 1 GC-MS QP2010S (Shimadzu), 1 GC-MS/MS GC 2010 – TQ 8040 – AOC 6000 (Shimadzu), 1 GC-AccuTof (Jeol), 1 HPLC-IT-MS LCQ-Deca (Thermo Fisher Scientific), 1 UPLC-PDA /TQD-MS (Waters), 1 UPLC-PDA /TQD-MS Quattro Premier (Waters)


Laboratoire de GC-MS et service

Le laboratoire de service en GC-MS fournit des prestations d’acquisition de données utilisant la GC couplée à des méthodes de spectrométrie de masse faible ou haute résolutions. Le laboratoire dispose de plusieurs instruments de spectrométrie de masse équipés de sources de type ionisation électronique (EI) et ionisation chimique (CI), avec des analyseurs de type simple quadrupôle, triple quadrupôle, à secteur magnétique (IRMS), et à temps de vol (Q-Tof).
Les atouts du laboratoire sont :
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d'acquérir des données à partir d'une large gamme d'instruments de GC-MS,
  • l’offre de méthodes GC-MS complémentaires pouvant être appliquées à la fois en lipidomique (analyse d’acides gras), en fluxomique, pour des approches de métabolomique ciblées et non ciblées, ainsi que pour des études structurales pour l’identification de métabolites.
 
 

Laboratoire de LC-MS et service

Le laboratoire de service en LC-MS fournit des services d’acquisition de données en utilisant la chromatographie liquide couplée à des méthodes de spectrométrie de masse haute résolution (HRMS). Le laboratoire comprend différents types d’instruments de spectrométrie de masse comme des Q-ToF, LTQ-Orbitrap, Exactive, Q-Exactive et FTICR-MS. La couverture optimale du métabolome peut être réalisée par la mise en œuvre de différentes méthodes de spectrométrie de masse en injection directe (MS) ou avec des couplages de chromatographie (LC-MS). Ces méthodes analytiques sont capables de détecter une grande diversité structurale de métabolites.

Les atouts de ce laboratoire sont : 
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d’acquérir des données à partir d’une large gamme d’outils de HRMS et de LC-MS,
  • la disponibilité de méthodes complémentaires d’introduction directe-MS et de LC-MS permettant de réaliser le profilage de métabolites de très haute à moyenne polarité.