Formations aux outils développés par MetaboHUB

NMR Procflow

Objectif : Formation à l'utilisation du logiciel libre NMRProcFlow fournissant un ensemble complet d'outils pour le traitement et la visualisation des données RMN 1D, au sein d'une interface interactive basée sur la visualisation de spectres.
Durée : adaptée au niveau des participants
Site internet :
www.nmrprocflow.org
Contact : nmrprocflow-bordeaux AT inrae.fr

MetExplore personal training

Objectif : L'objectif de cette session d'une semaine est d'accompagner les scientifiques dans l'analyse de leurs profils métaboliques. Le stagiaire est totalement intégré dans une équipe de biologistes computationnels et peut interagir directement avec eux sur une base quotidienne. L'objectif est d'atteindre l'autonomie sur l'utilisation de l'analyse des données métabolomiques dans le contexte d'un réseau à l'échelle du génome. Les participants, en accord avec les formateurs, doivent préparer leurs données avant leur venue pour permettre une formation efficace.
Public : Scientifiques souhaitant être autonome dans l'analyse des réseaux 
Nombre de participants : 1
Langue : anglais ou français
Durée : quelques jours à 1 semaine
Frais d'inscription : 2500 € (académiques) 5000 € (industriels)
Prochaine session : sur demande
Programme : MetExplore et Cytoscape
Contact : Fabien.JourdanATinrae.fr
Site internet : www.metexplore.fr

Workflow4Experimenters (W4E): Using Galaxy and the Workflow4metabolomics infrastructure to analyse your metabolomics data sets (joint training from IFB and MetaboHUB)

Objectif : Le prétraitement, l'analyse statistique et l'annotation des données métabolomiques sont des tâches complexes. L'infrastructure en ligne Workflow4metabolomics fournit un environnement convivial et performant avec des modules de calcul avancés pour construire, exécuter et partager des flux de travail complets pour les analyses LC-MS, GC-MS et NMR. Giacomoni et al, 2015
Public : Expérimentateurs en LC-MS, GC-MS et RMN (biologistes, chimistes, ...)
Nombre de participants : 25
Durée : 10h de théorie et 1 semaine de pratique
Langue : anglais et français
Frais : 900 € (académiques) and 2000 € (industriels)
Prochaine session : 2025
Programme : Au cours de cette formation, les participants apprendront à utiliser l'infrastructure W4M pour analyser leur propre ensemble de données. Une première session en visio (5*2h) permettra de découvrir l'outil de manière théorique. La session en présentiel est consacrée à la pratique sur votre propre jeu de données, sous forme de tutorat.

Contact : w4e-organisation AT groupes.renater.fr
Site internethttp://workflow4metabolomics.org/
Support : IFB, MetaboHUB, RFMF, ELIXIR