Initiation à la 13C-Fluxomique
Objectif : Acquérir des connaissances théoriques et pratiques pour l'analyse des systèmes métaboliques de modèles cellulaires à l'aide d'approches en fluxomique du 13C.
Public : Doctorants, post-doctorants, chercheurs, ingénieurs, personnel technique. Pour les académiques et non-académiques ayant (i) des connaissances de base/intermédiaires en métabolisme, microbiologie et/ou biotechnologie, (ii) un projet en cours/à venir concernant le métabolisme, la microbiologie et la biotechnologie.
Durée : 4 jours (30h)
Frais d'inscription : sur demande
Programme :
Jour 1
- Introduction générale
- Biotechnologie et métabolisme
- Systèmes métaboliques
Jour 2
- Module 1 : Plan d'expérience et échantillonnage
- Cours théorique
- Cours pratique
- Fluxomique à haut débit à l'aide d'une plateforme robotisée
Jour 3
- Module 2 : Analyse et traitement des données
- Module 3 : Calcul des flux métaboliques
- Module 4 : Réseaux métaboliques pour l'exploration du métabolome
Jour 4
- Modélisation des flux métaboliques à l'échelle du génome ; réseaux métaboliques à l'échelle du génome
- Retour d'expérience et table ronde
- Conclusion et évaluation de la formation
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Lipidomique
Objectif : Disposer des bases théoriques et pratiques pour pouvoir analyser et quantifier les principales familles de lipides (acides gras, lipides neutres, phospholipides abondants et sphingolipides). La formation peut être adaptée sur demande à des composés mineurs tels que les eicosanoïdes, l'isoprostanoïne, les oxystérols...
Public : Scientifiques intéressés par l'analyse des lipides : étudiant, ingénieur, chercheur.
Nombre de participants : 3 à 5
Durée : 3 à 5 jours
Frais d'inscription : sur demande
Programme: Théorie sur une journée, 1 jour pour la préparation des échantillons, 1 à 3 jours pour le traitement des données et la quantification.
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Initiation à la Métabolomique
Objectif : Apporter les connaissances théoriques sur la métabolomique et des différents outils analytiques utilisés en métabolomique (spectrométrie de masse, RMN ) ainsi que d’initier aux pratiques expérimentales de base en métabolomique.
Public : ingénieurs ou assistants-ingénieurs
Nombre de participants : 3 à 8
Durée : 1 jour / 7h
Frais d'inscription : 670€
Programme :
-Qu’est ce que la métabolomique ? (Définition / principe)
-Pourquoi faire ? (Approches / domaines d’application)
-Quels outils pour quelles approches ? (Stratégies / équipements / schémas)
Site web : INSA Toulouse formation
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Extraction et analyse des phytohormones par spectrometrie de masse
Objectif : Apporter les connaissances fondamentales et pratiques pour extraire et quantifier des phytohormones de façon relative ou absolue par spectrométrie de masse.
Public : techniciens supérieurs, ingénieurs et chercheurs
Nombre de participants : 2 à 3
Durée : 3 jours / 19h
Frais d'inscription : 1500€
Programme : COURS THÉORIQUES (1 jour) :
1.Introduction au métabolome végétal.
2.Choix de la méthode d’extraction en fonction des phytohormones ciblées.
3.La spectrométrie de masse pour l’analyse des petites molécules:
Instrumentation / Stratégie d’identification/ Stratégie de quantification Techniques de couplage (GC-MS, LC-MS)
TRAVAUX PRATIQUES (2 jours)
-Extraction des phytohormones
-Préparation des échantillons (SPE, dérivatisation …)
Analyse par couplage LC-MS et/ou GC-MS
-Traitement des données
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Métabolomique quantitative par spectrométrie de masse
Objectif : Apporter les connaissances fondamentales et pratique pour quantifier des métabolites ed facon relative ou absolue par spectrométrie de masse dans un contexte d’approche métabolomique.
Public : techniciens supérieurs, ingénieurs et chercheurs
Nombre de participants : 3 à 6 personnes
Durée : 3 journée / 19h
Frais d'inscription : 1310€/personne
Date et lieu de la prochaine session : Sur demande pour groupe supérieur à 3. Toulouse
Programme :
COURS THÉORIQUES (1,5 JOURS) :
1.Introduction au métabolome
2. Fondements en spectrométrie de masse pour l’analyse des petites molécules: Instrumentation / Stratégie d’identification/ Stratégie de quantification Techniques de couplage (GC-MS, LC-MS, CE-MS)
3. Stratégies d’analyse du métabolome et applications
TRAVAUX PRATIQUES (1,5 JOURS)
- Quantification des métabolites intracellulaires d’Escherichia coli : Préparation des échantillons/Techniques d’extraction/Quenching
- Analyse par couplage IC-MS/MS
- Quantification par dilution isotopique généralisée (IDMS)
- Traitement des données
Site web : INSA Toulouse formation
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Traitement de données sur MSDial/MSCleanR/MSFinder
Objectif : Se former à l'obtention d'une liste de pics annotés à partir des fichiers bruts en utilisant MSDial/MSCleanR/MSFinder.
Public : chercheurs, doctorants, post-doctorants
Durée : 1 jour
Frais d'inscription : sur demande
Programme : adapté en fonction des participants
Format : distanciel
Langue : anglais ou français
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Ecoresponsabilité sur les plateformes
Objectif : Mettre en place et gérer l'ecoresponsabilité au sein des plateformes en biologie santé
Durée : 2h
Frais d'inscription : sur demande
Format : présentiel
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BioStatFlow et MetaboAnalyst
Objectif : Se former aux analyses uni- et multivariées avec l'outil BioStatFlow ou MetaboAnalyst
Format : présentiel ou distanciel
Durée : adaptée au niveau des participants
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MS-DIAL
Objectif : Se former aux analyses bioinformatiques pour le traitement des données LC-MS
Format : présentiel ou distanciel
Durée : adaptée au niveau des participants
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Chimiométrie
Objectif : Se former aux analyses uni- et multivariées appliquées aux données métabolomiques
Format : présentiel ou distanciel
Durée : adaptée au niveau des participants
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Traitement de données en métabolomique
Objectif : Se former au traitement de données en métabolomique : Extraction et annotation données de MS.
Format : présentiel à Clermont-Ferrand ou distanciel
Durée : adaptée au niveau des participants
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Traitement de données en métabolomique W4M
Objectif : Se former au traitement de données en métabolomique : Présentation et prise en main des outils W4M.
Format : présentiel à Nantes
Durée : 1 à 2 jours
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Spectrométrie de masse haute résolution
Objectif : Se former sur les bases de spectrométrie de masse haute résolution
Format : présentiel à Nantes
Durée : 6h
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