Si vous travaillez avec MetaboHUB, merci d'insérer ces remerciements dans la partie "funding" de vos articles :
This work was supported by MetaboHUB funded by the Agence Nationale de la Recherche under the France 2030 program (MetaboHUB ANR-11-INBS-0010 ; MetEx+ ANR-21-ESRE-0035; MetaboHUB (JVCE) ANR-24-INBS-0012).
Le catalogue de services de MetaboHUB : des métabolites aux flux présente 58 services couvrant 9 domaines d'application. Il offre également un aperçu des programmes de formation, des équipements disponibles, ainsi que des informations sur nos e-tools. Pour toute autre question, visitez notre page MAMA.
L'infrastructure MetaboHUB rassemble les équipements, les moyens, les compétences et les ressources pour lever les verrous de la métabolomique actuelle et de demain.
La métabolomique, la lipidomique et la fluxomique sont des approches complexes qui nécessitent de nombreux outils & approches :
- Besoins d'outils analytiques : aucune technologie ne peut à elle seule détecter tous les métabolites d'un milieu biologique car ces molécules sont de natures physico-chimiques très diverses. Ainsi, le profilage chimique d'un échantillon requiert une combinaison de différentes techniques analytiques, principalement basées sur la Résonnance Magnétique Nucléaire (RMN) et la Spectrométrie de Masse (MS).
- Besoins d'outils pour l'étude de cohortes : comme c'est le cas pour la génomique et la protéomique, la métabolomique évolue vers des projets à grande échelle nécessitant des capacités technologiques et une expertise pour analyser une grand nombre d'échantillons tout en tenant compte de la quantité importante de données biologiques et cliniques générées. MetaboHUB travaille sur l’ensemble des outils qui permettront dans un futur proche l’intégration des outils nécessaires à l'exploitation de grands jeux d’échantillons.
- Besoins de compétences multiples : la métabolomique fait appel à de multiples compétences en informatique, en traitement du signal, en statistique, en analyse, gestion des données et en apprentissage, mais aussi à des compétences et de l'expertise dans les différents domaines d'enjeux stratégiques où la métabolomique permet des avancées en médecine, en nutrition humaine, en biotechnologies vertes et blanches et en environnement.
- Besoins d'outils vers la biologie des systèmes : l'intégration des technologies et des compétences va permettre d'accélérer notre compréhension des réseaux métaboliques et de leur fonctionnement dynamique et d'expliquer et/ou d'optimiser les processus biologiques. Il est nécessaire de développer les approches bioinformatiques pour permettre l'annotation précise du métabolome des espèces vivantes majeures afin d'intégrer ces données avec celles issues d'analyses complémentaires telles que : la génomique fonctionnelle, la protéomique, les activités enzymatiques, les flux métaboliques. Cela permet de construire des modèles in silico afin de prédire les comportements métaboliques fournissant ainsi un cadre méthodologique et conceptuel pour la biotechnologie prédictive.
- Besoins en bioinformatique & biostatistiques : MetaboHUB développe également des outils de bioinformatique pour exploiter au mieux les données analytiques. Ils concernent le traitement, l'analyse, et l'annotation des données associés à une expertise sur chacune des étapes de l'analyse, permettant à la communauté d'obtenir un traitement performant et convivial des informations issues de technologies multiples jusqu'à une annotation rigoureuse et détaillée.