Past trainings


Researchers Schools / Workshops


12th annual conference of Metabolomics Society

Workshop: Computational Workflows and Workflow Engines: Monday 27th June 2016 - 13:30 - 15:00
Organisers: Mark Viant, Ralf Weber, Warwick Dunn, Pablo Moreno, Reza Salek, Christoph Steinbeck and the PhenoMeNal consortium
Lieu: Dublin, Ireland

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27 to 30 june 2016

33rd edition of JFSM

In French only: "Implémenter un système qualité dans un laboratoire de spectrométrie de masse"
27 September 2016, 13h00 to 17h00
Organisation and animation: Brice Bouyssiere (Université de Pau et des Pays de l'Adour):
Speakers: I. Schmitz (Univ. Rouen), J. Widart (Univ. Liège, MS Expertise), H. Paucot (Formation & Conseil UT2A).
Location: Centre de congrès Cité Mondiale, 20 Quai des Chartrons, 33000 Bordeaux, France. Salle "Brasilia" (niv. -1)

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27 to 30 September 2016

12th GERLI international lipidomics meeting

"MICROBE and HOST LIPIDS": From infections to microbiota and imaging
Location: Toulouse, France

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23 to 26 October 2016

Researchers School: "Data processing, analysis and annotation with the online Workflow4metabolomics computational infrastructure"

"Data processing, analysis and annotation with the online Workflow4metabolomics computational infrastructure" 
Location: Roscoff, France

21 to 25 September 2015

Researchers School: “Challenge and progress in the annotation and identification of de novo small molecules of biological origin”

“Challenge and progress in the annotation and identification of de novo small molecules of biological origin”
Location: Gif sur Yvette, France

23 to 24 October 2014

Researchers School: “The “Mass spectrometry and metabolomics, from the design of experiments to data integration in metabolic networks”

“The “Mass spectrometry and metabolomics, from the design of experiments to data integration in metabolic networks” 
Location: La Colle sur Loup, France

6 to 10 October 2014

Researchers School: “FT-MS analysis and food and environmental toxicology”

“FT-MS analysis and food and environmental toxicology” 
location: Clermont-Ferrand, France

31 March to 4 April 2014

Formation « 13C-fluxomique appliquée aux cellules cancéreuses »

FORMATION: 13C-FLUXOMIQUE APPLIQUÉE AUX CELLULES CANCÉREUSES
Cette formation a pour objectif l’acquisition de connaissances théoriques et pratiques de l’analyse des systèmes métaboliques par des approches de fluxomique appliquée au domaine du cancer.
- Date: du 13 au 16 nov. 2018
- Durée du stage : 4 jours – 30 heures
Plus de renseignement: Télécharger le fichier

Journées Lipidomystes

Journées Lipidomystes
Lieu: LYON
Date: 25 et 26 octobre 2018

Nous parlerons de préparation d'échantillons, de lipidomique globale, de traitement de données, de biophysique des membranes et de RMN...

Voici le lien pour vous inscrire : https://lipidomystes.sciencesconf.org/

Comme chaque année vous êtes les bienvenus pour faire des petites présentations techniques dans les thématiques proposées, n'hésitez pas à vous lancer!

Workshop "Analyse et interprétation des données en protéomique et métabolomique : points communs et spécificités"

Organisée conjointement par le R.F.M.F. - Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, la S.F.E.A.P. - Société Française d’Electrophorèse et Analyse Protéomique, ProFI - Infrastructure nationale de protéomique et MetaboHUB - Infrastructure nationale de métabolomique et fluxomique: https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/conference.php
La protéomique et la métabolomique sont deux sciences "omiques" complémentaires pour l'étude du vivant et la médecine personnalisée, qui partagent notamment une technique analytique commune : la spectrométrie de masse. Nous sommes heureux de vous accueillir à ce workshop qui est constitué de deux parties visant à présenter un état de l'art sur l'analyse et l'interprétation des données dans chaque discipline, et à faire émerger des axes thématiques transverses. https://framaforms.org/workshop-analyse-et-interpretation-des-donnees-en-proteomique-et-metabolomique-points-communs-et

Date : Mercredi 28 mars 2018

Lieu : Forum Labo (Centre de congrès de Lyon)

HALLS 4/5/6 - ENTREE B
50 Quai Charles de Gaulle - 69463 Lyon cedex 06
Infos pratiques : https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/infos.php

Intensive course at Tsukuba University (Japan) and Pontifical Catholic University of Chili

The following intensive course has been held on February 26th - March 2nd 2018 at Tsukuba University (Japan) and from March 22nd -March 27th 2018 at Pontifical Catholic University of Chili.

Subject name:Metabolomics: an emerging but powerful tool to study biology

Lecturer:Dr. Dominique Rolin (Professor, University of Bordeaux)

Credit:1.0 Credit

Room:F106 seminar room, Institute of Biological Agricultural Science building

Summary:In the post-genomics era, metabolomics represents a new «  omics tool » that in the last decade has received increased attention in many biological fields such as white and green biotechnology, nutrition, plant physiology, microbiology, etc. Metabolomics is based on the holistic study of the metabolic profile that characterizes a specific phenotype in a biological system. This course is going to give an overview on metabolomics approach in biology and will present the technological diversity to carry out metabolic. 

Lecture schedule:

26-Feb.    Introduction to functional genomic & metabolomics

27-Feb.    Metabolomics and its workflow

28-Feb.    NMR as analytical tool

1-Mar.      LC-MS and GC-MS as analytical tools

2-Mar       Examples of application

Toulouse School of Lipids 2018

La Toulouse School of Lipids s'est déroulée les 29-30 et 31 janvier 2018 en français.

L’objectif de cet enseignement est de donner aux participants les bases des connaissances sur les lipides, leur diversité, leurs biosynthèses et leurs rôles mais également de les familiariser avec les méthodes d’étude moderne de lipidomique. Les aspects les plus actuels de la recherche sur les grandes familles de lipides et leur implication en pathologie humaine seront abordés Télécharger le programme

License 3 Sciences de la vie (Projet Scientifique en Anglais)

Location : Uni Bordeaux
Date : 01/01/2019
Number of students : 40
Trainer's name : P Pétriacq
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master Biochimie et Bio Mol (Lipidomique)

Location : Uni Bordeaux
Date : 09/2019
Number of students : 15
Trainer's name : L Fouillen
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master 2 B2AS (Plant Cell Metabolism)

Location : Uni Bordeaux
Date : 10/2019
Number of students : 9
Trainer's name : P Pétriacq
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master 2 Phytochimie

Location : Uni Bordeaux
Date : 4/11/2019
Number of students : 10
Trainer's name : P Pétriacq
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master 2 GIP-TRIAD (IOB)

Location : Uni Bordeaux
Date : 4/11/2019
Number of students : 10 et 11/ 2019
Trainer's name : D Rolin, P Pétriacq
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master 1 Microbiologie (mutualisé)

Location : UCA
Date : sept-nov 2019
Number of students : 40
Trainer's name : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand

Master Uiversité de Tsukuba

Location : Uni Bordeaux
Date : 01/01/2019
Number of students : 8
Trainer's name : D Rolin
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Master 1 Biologie-santé (mutualisé)

Location : UCA
Date : sept-nov 2019
Number of students : 10
Trainer's name : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand

Master 1 Bioinformatique (mutualisé)

Location : UCA
Date : sept-nov 2019
Number of students : 15
Trainer's name : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 Microbiologie

Location : UCA
Date : oct. 2019
Number of students : 30
Trainer's name : AM Delort, C Jousse
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 Bioinformatique

Location : UCA
Date : nov-dec 2019
Number of students : 10
Trainer's name : C Jousse
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 4/11/2019
Number of students : 30
Trainer's name : L Debrauwer
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 4/11/2019
Number of students : 30
Trainer's name : C Canlet
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 Toxicologie humaine, évaluation des risques et vigilance

Location :Univ Paris-Descartes
Date : 5/11/2019
Number of students : 12
Trainer's name : L Debrauwer
Plateform's name : MTH-Toulouse

Licence 3

Location : UPS
Date : 1/3/2019
Number of students : 71
Trainer's name : C Berges
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Location : UPS
Date : 1/9/2019
Number of students : 12
Trainer's name : F Bellvert
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 01/10/2019
Number of students : 30
Trainer's name : F Bellvert
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 Microbio-Santé

Location : Université de Lyon
Date : 11/2019
Number of students : 40
Trainer's name : F Bellvert
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 1 BBT

Location : UPS
Date : 03/2019
Number of students : 11
Trainer's name : E Cahoreau
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Location : UPS
Date : 2-3/12/2019
Number of students : 11
Trainer's name : E Cahoreau
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 3/11/2019
Number of students : 30
Trainer's name : P Le Faouder
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 3/11/2019
Number of students : 30
Trainer's name : J Bertrand-Michel
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 OMIC

Location : Paris 6
Date : 1/11/2019
Number of students : 16
Trainer's name : J Bertrand-Michel
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Location : UPS
Date : 25/9/2019
Number of students : 12
Trainer's name : J Bertrand-Michel
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 Biologie végétale

Location : UPS
Date : 7/10/2019
Number of students : 35
Trainer's name : S Fournier
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 Biologie végétale

Location : UPS
Date : 17-21/10/2019
Number of students : 35
Trainer's name : S Diarrassouba; J Chervin; V Puech-Pages; S Fournier
Plateform's name : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Location : UPS
Date : 5/11/2019
Number of students : 30
Trainer's name : S Fournier
Plateform's name : MTH-Toulouse

BTS Anabiotech Auzeville

Location : LRSV-Toulouse
Date : 14/11/2019
Number of students : 15
Trainer's name : S Fournier
Plateform's name : MTH-Toulouse

DU Plantes à Valeur Santé/ Master 1 B2AS

Location : Uni Bordeaux
Date : 7-10/10/2019
Number of students : 18
Trainer's name : P Pétriacq, J Valls
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Systems Immunology

Location : Sorbonne université
Date : 27/11/2019
Number of students : 18
Trainer's name : E Thévenot
Plateform's name : MTH-Saclay

DU Bioinformatique intégrative (DUBii)

Location : Univ Paris
Date : 19/2/2019
Number of students : 17
Trainer's name : F Jourdan
Plateform's name : MTH-Toulouse

Journée thématique sur les autorités des données (FAIR)

Location : Toulouse
Date : 8/4/2019
Number of students : 100
Trainer's name : D Jacob
Plateform's name : MTH-Bordeaux

GERM (traitement données RMN)

Location : Ile d'Oléron
Date : 26-29/05/2019
Number of students : 30
Trainer's name : D Jacob
Plateform's name : MTH-Bordeaux

R-applications

Location : MNHN-UPMC, Paris
Date : 16/5/2019
Number of students : 20
Trainer's name : D Jacob
Plateform's name : MTH-Bordeaux

Metabolomics Workshop: From Study Design to Metabolite Annotation

Location : Pretoria, Afrique du sud
Date : 11-15/03/2019
Number of students : 25
Trainer's name : F Jourdan
Plateform's name : MTH-Toulouse

IBPS Summer School on Endocrine Distruptors

Location : Paris
Date : 27/8/2019
Number of students : 10
Trainer's name : F Jourdan
Plateform's name : MTH-Toulouse

EMBO Practical Course on Metabolomics Bioinformatics for Life Scientists

Location : Lyon
Date : 16-20/09/2019
Number of students : 25
Trainer's name : F Jourdan; J Bertrand-Michel
Plateform's name : MTH-Toulouse

Flux Cancer

Location : Toulouse
Date : 8-11/10/2019
Number of students : 11
Trainer's name : JC Portais; JE Sarry; L Stuani; M Heuillet; C Berges; N Butin; J Bertrand-Michel; A Tournadre; E Cahoreau; F Bellvert; F Jourdan; N Poupin
Plateform's name : MTH-Toulouse

Lipidomic course

Location : Pretoria, Afrique du sud
Date : 11-15/03/2019
Number of students : 25
Trainer's name : J Bertrand-Michel
Plateform's name : MTH-Toulouse

Ecole mixte CHEMOMICS

Location : Sète
Date : 18-21/11/2019
Number of students : 38
Trainer's name : F Giacomoni, M Tremblay-Franco
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand, MTH-Toulouse

Mass spectrometry: LC-MS analysis

Location : GTN training material
Date : 06/2019
Nomber of consultations : 
Trainer's name : M Pétéra
Plateform's name : MTH-Clermont-Ferrand


e-MetaboHUB: W4M, MetExplore, NMRProcFlow, PeakForest


MetExplore

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Using Galaxy and the Workflow4metabolomics infrastructure to analyse metabolomics data

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