Métabolomique: De la production des données aux approches analytiques et aux applications
Métabolomique
De la production des données aux approches analytiques et aux applications
Lille, 15 octobre 2019
La plateforme de bioinformatique de Lille, bilille, organise le 15 octobre prochain une journée scientifique consacrée à la métabolomique: de la production des données aux approches biostatistiques et bioinformatiques pour le traitement des données. Nous aborderons également les applications en santé, en nutrition, en microbiologie et en biologie végétale.
La métabolomique est un champ scientifique en plein développement qui permet l’identification et la quantification des métabolites présents à un instant donné, dans des conditions données au sein de la cellule. Ces mesures permettent de rendre compte des changements métaboliques qui s’exercent au sein d’un système comme résultante de l’expression du génome en interaction avec son environnement. Les applications sont nombreuses et transverses, que ce soit en santé, en microbiologie ou en biologie végétale par exemple.
L'objectif de cette journée est de présenter à la fois les principes de bases de la métabolomique et les ressources biostatistiques et bioinformatiques disponibles pour l'analyse de ces données.
Programme
- 9h15-9h40: Café de bienvenue
- 9h40-9h45: Introduction de la journée
- 9h45-10h35: Dominique Rolin, directeur de MetaboHUB, Bordeaux
- 10h35-11h20: Workflow4metabolomics (W4M), portail dédié à l’analyse métabolomique: extraction de données, normalisation, analyses statistiques et annotations, Jean-François Martin, MetaboHUB-Toulouse, UMR 1331 Toxalim, INRA Toulouse
- 11h20-11h40: Pause
- 11h40-12h25: Mélanie Pétéra, PFEM, MetaboHUB-Clermont, Univ Clermont Auvergne, INRA, UNH
- 12h25-12h45: Metabolomics in Alzheimer's disease, Vincent Damotte, Inserm U1167, Institut Pasteur de Lille
- 12h45-14h30: Déjeuner (RU Pariselle)
- 14h30-15h15: Connecting the dots: metabolic networks for metabolome mining, Fabien Jourdan, MetaboHUB-Toulouse, UMR 1331 Toxalim, INRA Toulouse
- 15h15-16h00: Data sciences for deep phenotyping and precision medicine, Etienne Thevenot, MetaboHUB-IdF, CEA, LIST, Laboratory for data sciences and decision
- 16h00-16h20: Métabolomique appliquée à l’identification de biomarqueurs en sélection variétale, Philippe Hance, Institut Charles Viollette, Université de Lille
- 16h20-16h40: La bioinformatique des peptides nonribosomiques, des métabolites secondaires microbiens remarquables, Valérie Leclère, Institut Charles Viollette, Université de Lille
Inscription
L'inscription est gratuite, mais obligatoire. Elle comprend les pauses cafés et le déjeuner.
Date limite: 5 octobre 2019
Accès
La journée se tient à Polytech'Lille, amphi Migeon (rez-de-chaussée). La station de métro la plus proche est Quatre Cantons, terminus de la ligne 1.
Comité d'organisation
Philippe Hance (ICV), Valérie Leclère (IVC), Pierre Pericard (bilille), Hélène Touzet (CRIStAL)
Source : liste bioinfo
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